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ddCTP 2',3'- 双脱氧胞苷三磷酸 无 DNase/RNase Sanger 测序 DNA 末端终止分子生物学科研试剂

发表时间:2026-06-24

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ddCTP(2',3'- 双脱氧胞苷三磷酸)属于修饰型脱氧核苷三磷酸衍生物,本品经过无核酸酶工艺精制制备,不含 DNase、RNase、蛋白酶及内毒素杂质,广泛应用于 Sanger 双脱氧终止法 DNA 测序、DNA 聚合酶催化机理研究、基因定点突变验证、核酸链延伸抑制实验、高通量测序文库构建等分子生物学科研场景。分子式C9H15N3O12P3,分子量 439.14,常规规格多为 100 mM 高纯水溶液,液体澄清无浑浊、无沉淀,批次浓度、纯度、酶促反应活性高度统一。采用超纯水配制,缓冲体系 pH 精准稳定,密封置于 - 20℃避光低温环境储存,避免反复冻融,规范存放条件下稳定保质期可达 24 个月。

本品与天然 dCTP 结构的核心差异在于核糖 3' 位缺少羟基基团,无法形成 3',5'- 磷酸二酯键,当被 DNA 聚合酶掺入正在延伸的 DNA 子链末端后,会直接终止核酸链的继续延伸;凭借碱基互补配对原则可特异性与模板链上鸟嘌呤 G 位点结合,是经典 Sanger 测序技术中精准标记 C 碱基位置的核心终止试剂,无需实验人员自行纯化、浓缩配制,适配一代测序、聚合酶生化机理探究、核酸抑制动力学等高精密分子实验场景。



DNA 链双脱氧终止机制:天然 dNTP 依靠核糖 3' 羟基与下一个核苷三磷酸的 5' 磷酸基团形成磷酸二酯键实现核酸链不断延伸;ddCTP 缺失 3'-OH,在 DNA 聚合酶作用下通过碱基互补配对掺入 DNA 链 3' 端后,无法继续连接后续核苷酸,直接终止子链延伸,产生大量长度不一、以 C 碱基为末端的 DNA 片段,通过电泳分离即可精准定位模板序列中胞嘧啶位点,完成 Sanger 法 DNA 测序。碱基特异性互补识别机制:ddCTP 携带胞嘧啶碱基,仅能与模板链中的鸟嘌呤 G 特异性配对,不会与 A、T、C 碱基发生非特异性结合,可精准实现单碱基位点终止,最大程度降低测序背景杂峰,保证测序峰图规整、碱基判读准确率高。DNA 聚合酶底物模拟机制:ddCTP 空间结构与天然 dCTP 高度相似,可被各类高保真 DNA 聚合酶、Taq 酶正常识别作为反应底物掺入核酸链,适用于不同聚合酶的催化活性、底物结合偏好、抑制剂动力学等酶学机理研究。

核酸延伸抑制调控机制:通过调节体系内 ddCTP 与 dCTP 的浓度比例,可可控调控 DNA 片段终止长度分布,优化测序片段梯度范围,适配长片段基因测序、微量模板测序、低拷贝基因序列鉴定等实验体系。


主要应用领域

1、Sanger 双脱氧法一代 DNA 测序

作为四种核心终止核苷三磷酸之一,用于基因片段、质粒载体、PCR 扩增产物的精准序列测定,实现单碱基水平的基因序列解析。

2、DNA 聚合酶生化催化机理研究

探究不同 DNA 聚合酶对双脱氧核苷底物的识别效率、结合亲和力,开展酶促动力学实验,筛选高保真、高测序性能的工程化聚合酶。

3、基因定点突变、SNP 位点验证实验

通过测序手段验证载体突变位点、单核苷酸多态性位点,确认基因编辑结果准确性,为基因功能、遗传多态性研究提供序列依据。

4、核酸链延伸抑制与药物靶点筛选

以 ddCTP 为工具试剂构建核酸终止模型,评价抗病毒核苷类药物对病毒 DNA 聚合酶的抑制作用,开展核苷类先导化合物活性筛选。

5、基因克隆载体序列确证实验

重组质粒、过表达载体、慢病毒载体全长测序鉴定,验证目的基因插入方向、序列完整性,规避移码突变、碱基缺失等实验风险。

6、分子生物学专业教学实训

Sanger 测序原理实操、DNA 聚合酶底物特异性探究、核酸生化反应动力学分析等实训课程,标准化无酶试剂保障实验重复性与数据可靠性。



ddCTP 凭借碱基配对特异性强、DNA 聚合酶底物兼容性优异、链终止效率稳定、无核酸酶杂质干扰、批次浓度精准可控等核心优势,成为 Sanger 一代 DNA 测序、聚合酶生化机理、基因序列验证领域不可或缺的核心分子科研试剂。有效解决自制核苷试剂纯度低、酶污染导致测序失败、终止效率不稳定等科研痛点,精准实现单碱基核酸链可控终止,保障基因测序结果精准可靠。当前依托 ddCTP 搭建的核酸终止测序、聚合酶酶活评价、基因序列验证科研体系,持续支撑基因功能验证、病原微生物分型鉴定、遗传突变筛查、核苷类抗病毒药物研发等热点科研课题。随着精准基因诊断、基因编辑、微生物分子溯源技术不断发展,高纯 ddCTP 将在长片段基因测序、聚合酶改造优化、靶向核苷类药物筛选领域持续发挥 DNA 链特异性终止作用,为分子生物学、遗传学、抗病毒药理学方向基础科研与转化试验提供底物活性稳定、纯度可靠、批次统一的标准化双脱氧核苷三磷酸科研保障。


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